Masjid Agung Baitussalam Purwokerto mengadakan kegiatan ibadah salat Jumat secara terbatas untuk pengurus dan warga setempat dengan protokol kesehatan ketat. Selain suhu badan dicek dengan infrared thermometer, jamaah diwajibkan menggunakan masker, dan lantai diberi tanda silang untuk mengingatkan ketentuan jaga jarak.